Tudo começou quando em Agosto de 2000 houve uma mobilização por parte da UNOESC, da FATMA e da SDM para criação do Comitê. Em Outubro 2000 aconteceu VI Semana da Engenharia com palestras que abordaram o tema e já em 20 de junho de 2001 realizou-se uma Assembléia Geral com escolha da Composição do Comitê.
Em 05 de julho de 2001 o Conselho Estadual de RECURSOS HÍDRICOS – CERH na SDM aprovou a composição do comitê.
Ficou decidido que o Comitê Rio do Peixe seria composto por 20% de integrantes do Governo, 40% de usuários do Rio, e 40% de ONGs (Organizações não-governamentais) totalizando 70 vagas/votos.
Em 20 de julho de 2001 convocou-se Assembléia com Escolha da Diretoria Provisória e da Comissão Consultiva. Dia 20 de agosto do mesmo ano aconteceu uma Reunião Ordinária do grupo de trabalho para elaboração do Regimento Interno. Dia 24 de setembro de 2001 houve uma Reunião para tratar dos acertos do Regimento Interno em Caçador – ACIC.
O seu lançamento oficial ocorreu no dia 24 de outubro de 2001 com aprovação do regimento interno por meio do Decreto No 5.627, de 04 de setembro de 2002 (Publicado no Diário Oficial de SC no 16.985, página 3, de 05 de setembro de 2002), sua cede jurídica encontra-se na cidade de Joaçaba - SC. Tem por símbolo o peixe Dourado, espécie em extinção considerada o rei do rio e adotou como lema principal: “Água para todos e sempre”.